機動車登記證書遺失了，機動車所有人應當向登記地車輛管理所申請補領、換領。機動車登記證書是車輛所有權的法律證明，由車輛所有人進行保管，不隨車攜帶。在辦理轉籍、過戶等任何車輛登記時都會要求出具，并在其上記錄車輛的有關情況，機動車登記證書相當于車輛的戶口本，如若遺失，需進行補領、換領。

補辦手續：

1、提供機動車所有人的身份證明：公用車要提供企事業單位的《組織機構代碼證書》；私家車要提供車主的身份證或戶口簿（須與登記時的證件一致），暫住人員還要提供有效期一年以上的《暫住證》。

2、提供行駛證、機動車的標準照片一張，填寫《補領、換領機動車牌證申請表》、《被盜搶機動車查詢表》，還要拓印發動機號、車架號各兩份。

3、登記審核窗口審核上述證明材料，符合規定的，向車主開具《待辦憑證》；不符合規定的，開具《退辦單》。

4、持《待辦憑證》到機動檢驗崗，核對發動機與車架的號碼，并查驗有無鑿改嫌疑，還要與全國被盜搶機動車信息系統比對。符合規定的，檢驗人員在證表上簽注意見。

5、車主于30天后憑《待辦憑證》領取《機動車登記證書》。

注意事項：

1、在辦理補領機動車登記證書時，機動車所有人應將車輛開到車管所。機動車所有人為自然人辦理補領機動車登記證書業務的，應本人到場申請，不能委托他人代理。

2、機動車所有人因死亡、出境、重病殘和不可抗力等原因不能到場補領機動車登記證書的，應當出具有關證明。