東莞南站是一座高鐵站的，具體的位置在塘廈林村社區。目前東莞南站是屬于贛深高鐵東莞段之中唯一的一個站點，站場規模是4臺8線。其中站房的占地面積已經達到28400平方米，對于這個規模來說，在贛深鐵路修建的車站之中排名處于第二的位置。

東莞南站這里是一座中型的鐵路車站，建筑總共的占地面積已經達到28400平方米，主體高度達到31.9米。同時站臺雨棚的占地面積達到18000平方米，配套停車場的規模已經達到1200平方米。站房可以同時1000人乘車，在遠期高峰期的時候，每小時輸送量大概是1200人。

東莞南站主要是屬于三層結構的高架車站，其中站房南北就在鐵路正下方的位置，具體的流線模式就是線上進站、線下候車、雙側雙向進出站。其中高架三層就是代表站臺層，高架二層就是候車廳，南北兩個地方都有設立進站口，乘客可以根據自身情況去選擇具體的進站口位置。

另外地面一層就是屬于架空層，在這里有設置售票廳、出站廳、換乘空間等。然后在站房兩邊有設置南廣場，北廣場，另外還有公路交通換乘的地方和公園。截止到2022年1月17日，在東莞南站每天鐵路發車的列車量達到100趟，發送旅客數量是3535人，抵達站點的旅客數量是846人。