在交管12123上處理違章時，能否進行扣分取決于幾個因素。其中一個重要因素是違章行為是否通過電子拍攝而非現場處罰。這意味著只有那些通過電子拍攝記錄的違規行為，才能在12123上進行處理，并可能導致扣分。

其次，我們了解到12123處理的違法業務中罰金不得超過200元，并且處理后的記分累計不能超過11分。這就意味著如果您的違章罰款超過200元或者處理該違章會導致您的記分超過11分，那么在12123上無法進行扣分處理。

此外，在使用12123處理違章時，還需要注意當前記分周期的累積情況。根據資料了解，當前記分周期累積不能超過12分，否則將無法在12123上直接扣分。