關于已過停止線但車身在斑馬線上的情況，是否扣分取決于具體的情況和當地的交通規定。

如果車輛在紅燈亮起之前已經完全過了斑馬線，那么可以繼續向前行駛，不用管紅燈是否亮起，這種情況下不會扣分。

如果在紅燈亮起之前，車輛只有一半或者車頭過了斑馬線，后半部分還在斑馬線以內，此時應該停在原地，不要再繼續往前開。在大多數地區，判斷是否闖紅燈需要三張照片作為證據：車輛過停止線、車輛經過路口、車輛到達對面路口。如果在紅燈亮起后，車輛前輪過了停止線，但立即停住且沒有明顯移動，這種情況一般不會被認為是闖紅燈，也不會扣分。

但是，如果車輛停在斑馬線上影響了其他車輛和行人的通行，交警在審核時可能會將其視為闖紅燈，根據相關規定，可能會處以罰款200元并記6分的處罰。

如果車輛前輪剛剛壓過停止線，馬上剎車停住且沒有明顯的移動，這種情況不屬于闖紅燈的行為，通常不會有處罰和記分。

需要注意的是，不同地區可能有不同的規定和執法標準，以上信息僅供參考。在實際駕駛中，應嚴格遵守當地的交通法規，確保行車安全。如果對具體的交通規定有疑問，建議咨詢當地的交警部門獲取準確信息。