醫大二院地鐵站位于哈爾濱市南崗區，醫大二院地鐵站同時屬于地鐵1號線、3號線，地鐵1號線醫大二院站去新疆大街方向，列車首班車時間：06:03，末班車時間：22:58；醫大二院站列車開往哈爾濱東站方向，列車始發時間：06:04，停運時間為22:46。地鐵3號線醫大二院站去太平橋方向，列車首班車時間：06:02，末班車時間：22:46；醫大二院站去體育公園方向，列車首班車時間：06:03，末班車時間：23:00。，另外在醫大二院可換乘地鐵1號線、地鐵3號線內環、地鐵3號線外環。

哈爾濱1號線 時間表

方向首班時間末班時間
開往 新疆大街 方向06:0322:58
開往 哈爾濱東站 方向06:0422:46

哈爾濱3號線 時間表

方向首班時間末班時間
開往 太平橋 方向06:0222:46
開往 體育公園 方向06:0323:00