在購車過程中，如果車輛的發票金額被故意低開，將會對車主帶來一系列問題和影響。

首先，低開發票會使車主在車損險保費方面受到損失。車損險是用于賠償車輛損失的險種，其保費金額通常與車輛開票價相同。然而，如果車輛發生交通意外導致報廢，低開發票將減少保險賠付金額，車主可能會面臨賠償不足的情況。

其次，低開發票還會影響車輛的二手轉售價格。在二手車交易過程中，車管所會根據車輛的二手車發票價重新定價。由于新車發票價也是一個重要因素，一些經驗豐富的二手車商人可能會利用低開發票來壓價，迫使車主以明顯低于市場價出售車輛。這將導致車主在出售車輛時面臨較大的損失。

另一方面，低開發票也會對車主帶來一些利益。首先是車輛商業保險價格的下降。商業險費用與車輛售價正相關，而車損險是商業險中費用最高的部分。低開發票將降低發票金額，從而降低車輛商業險費用。其次，低開發票還會減少車輛購置稅。購置稅的計算公式中，發票價與購置稅費用有關，低開發票將導致購置稅減少。

如果發現裸車價和發票價格不一致，車主不必過于擔心，因為發票的價格已經包含了裸車價。然而，如果發票價格與實際支付的費用不符，則存在低開發票的違法行為，車主應及時采取行動，維護自己的合法權益。