現代瑞納變速箱5速手動和4速自動變速箱，為國產變速箱。變速箱配置上，瑞納采用的是4AT變速箱，雖然擋位不多，但是勝在換擋平順行車質感不錯。賽歐3則采用的是5AMT機械式自動變速箱，在換擋的平順性上不及自動變速箱的瑞納。

在日常行駛中，如果行車電腦判斷到當前發動機的瞬時油耗低于預設值，此時儀表盤便會顯示“ECO”字樣，也就是經濟行駛模式，便于駕駛者養成良好的駕駛習慣。至于那臺4速自動變速器，它盡力的工作表現讓人挑不出什么毛病，一般正常駕駛情況下你只會輕微感覺到它在提升或降低擋位，就算是需要它降擋提速而突然深踩油門，也無需等待多時便能立刻做出反應。