摩托車協議過戶存在一定的風險。對于買家和賣家來說，都有不利之處。如果摩托車沒有過戶，賣方需要承擔摩托車所引發的各種費用。例如，如果買方沒有進行年審，那么罰款責任會由賣方承擔。此外，如果發生交通事故且肇事逃逸，責任也將由賣方承擔。

對于買方來說，摩托車未過戶可能會給將來賣車帶來麻煩，因為無法轉讓所有權。此外，未過戶的摩托車所有權仍然屬于賣方，如果車輛丟失，很難找回。而且，如果發生交通事故，可能會被認定為黑車，甚至交警查到后可能會沒收車輛。

摩托車協議過戶實質上是雙方自行簽訂所有權轉讓協議，并簽字畫押，以完成摩托車的買賣交易。然而，該車輛未辦理過戶登記，通常情況下這樣的所有權轉移是沒有法律效力的。根據《中華人民共和國民法典》，不動產權的設立、變更或轉讓等都需要依法登記，才具有法律效力。未經登記的過戶是無效的，除非法律有特殊規定。

因此，在購買二手摩托車時，應按照正常流程前往車管所辦理摩托車過戶手續，以避免在使用過程中出現問題，避免造成人財損失。