大眾凌渡配備了7擋雙離合變速器，并且這款變速器提供了手動駕駛模式，除了可以像自動擋一樣開，也能偶爾像手動擋一樣手動換擋。雖然大眾凌渡自動變速器換擋操作簡單，但也有一些需要注意的地方。

1.當大眾凌渡的換擋桿處于P或N擋時，鎖止機構會防止換擋桿直接切換檔位導致意外發生，因此在P或N擋切換到其他檔位是需要按住檔桿上的解鎖按鈕并踩住剎車。

2.在經過N擋迅速換擋時（如從R切換到D/S），檔桿不會被鎖止。如果在制動踏板處于未踩下狀態超過2秒時和車速低于5km/h時選檔桿在N擋，則檔桿會被鎖止。

3.當檔桿第一次掛入D/S擋時，變速器處于D擋，沿著箭頭方向向下撥一下，切換到S擋，但檔桿會自動跳回D/S位置。每撥一次，檔桿會在D擋和S擋之間切換。

4.檔桿在D/S擋時，將擋桿向右邊撥動切換到手動模式，在手動換擋的模式下，將檔桿向前推加檔，向后拉減檔，并且方向盤處配有撥片的也可以通過撥片控制加減擋。