本田雅閣使用雙溫區自動空調，按鈕不多，淺顯易懂好上手。主要包括了主副駕駛位空調出風口溫度及風量調節，出風口模式的選著按鈕，內外循環的設定及擋風玻璃加熱功能。

可以轉動溫度調節旋鈕開啟熱風功能，一般在車輛剛啟動不久不要開啟熱風功能，因為熱風的產生是有發動機冷卻水部分的熱量產生的，開啟后會增加熱車時間。對于配備自動空調的車輛，開啟自動空調（AUTO）后，系統會根據溫度自動調節出風口風量的大小，使車內更加舒適。

現在在一些高配的車型中，普遍使用觸摸式空調控制面板，占用位置更小組合的功能更多，同時還能顯示車內車外溫度，操作也更加方便，外觀更加時尚帶有很強的科技感，車載系統還能通過手勢調節音量大小、鼓風機轉速、溫度高低也是可以實現的，是未來空調控制面板的發展趨勢。